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Wissenschaftlicher Mitarbeiter (m/w/d) Institut für Medizinische Mikrobiologie und Krankenhaushygiene

Otto-von-Guericke-Universität Magdeburg Medizinische Fakultät

Magdeburg

Aktualität: 19.07.2021

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19.07.2021, Otto-von-Guericke-Universität Magdeburg Medizinische Fakultät

Magdeburg

Wissenschaftlicher Mitarbeiter (m/w/d) Institut für Medizinische Mikrobiologie und Krankenhaushygiene

Entwicklung von Algorithmen zur primären und sekundären Analyse von NGS-Sequenzdaten (mikrobielle Genomik, Mikrobiomanalyse) Entwicklung und Wartung von bioinformatischen Pipelines und Datenbanksystemen zur Speicherung und Bearbeitung von NGS-Daten Entwicklung von Web-Applikationen u. a. zur epidemiologischen Analyse

Hochschulabschluss in Bioinformatik oder verwandten Fachrichtungen; vorzugsweise mit Promotion Erfahrungen mit der Generierung und Analyse / Interpretation von mikrobiellen NGS-Daten, vorzugsweise mit long-reads (ONT) Programmiererfahrung mit Python, bash, R/Bioconductor Erfahrungen mit Bioinformatik-Tools zur Entwicklung von Pipelines im Bereich DNA- / RNA-Sequenzierung wie Snakemake oder CWL Kenntnisse in der Entwicklung von Datenbanksystemen Wünschenswert sind Kenntnisse in der Entwicklung von Web-Applikationen mit R/Shiny o. ä. Gutes mündliches wie schriftliches Ausdrucksvermögen im Deutschen wie im Englischen

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Berufsfeld

Informationstechnologie, TK IT/TK Softwareentwicklung Öffentlicher Dienst, Verwaltung Softwareentwicklung Ernährung, Lebensmittel, Agrar Datenbanken Webdesign, Multimedia Forschung, Lehre Forschung & Entwicklung

Standorte

Magdeburg

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