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Wissenschaftlerin / Wissenschaftler für den Bereich Bioinformatik (w/m/d)
Kulmbach
Aktualität: 19.08.2026
Anzeigeninhalt:
19.08.2026, Max Rubner-Institut
Kulmbach
Wissenschaftlerin / Wissenschaftler für den Bereich Bioinformatik (w/m/d)
Aufgaben:
Entwicklung, Implementierung, und Wartung von Anwendungen und Pipelines für die automatisierte Auswertung von Daten aus biochemischen Untersuchungsmethoden
Auswertung von Daten aus der DNA-sequenzbasierten Analytik (Metabarcoding, Metagenomics) sowie aus der Massenspektrometrie (Metabolomik, Proteomik)
Qualifikationen:
Das bringen Sie mit:
Ein erfolgreich abgeschlossenes Master-Studium im Bereich Informatik, Bioinformatik, Data Science, Molekularbiologie, Biochemie, Lebensmittelchemie oder eine vergleichbare Qualifikation
Praxis-Erfahrung im Aufbau von Analyse-Pipelines für NGS, Proteomik oder Metabolomik
Sicherer Umgang mit relevanten Datenbanken (z. B. NCBI, BOLD, Mascot, PRIDE, ProteomeXchange, METLIN, MassBank)
Fundierte Kenntnisse in gängigen Programmiersprachen (Python, Perl, R, C/C++, )
Routiniert im Arbeiten mit Linux, der Kommandozeile sowie HPC- bzw. Server-Umgebungen
Mindestens gute Kenntnisse der englischen Sprache in Wort und Schrift
Sehr gute Ausdrucksfähigkeit in deutscher Sprache in Wort und Schrift
Wünschenswert sind:
Erfahrung mit der bioinformatischen Auswertung von Sequencing-by-Synthesis (Illumina) oder Long-Read-Sequencing (Oxford Nanopore) Daten, inklusive Tools wie DADA2, QIIME 2, BLAST und taxonomischer Zuordnung
Sicherer Umgang mit Container-Technologien (z. B. Docker, Podman)
Erfahrung in der Arbeit mit Referenzdatenbanken
Nachgewiesene Mitarbeit an wissenschaftlichen Publikationen
Praktische Kenntnisse in relationalen Datenbanksystemen, vorzugsweise PostgreSQL
Erfahrung im Umgang mit Versionsverwaltungssystemen, insbesondere Git
Sicherer Umgang mit KI-gestützten Programmierwerkzeugen (z. B. Agentic Coding)
Wir freuen uns auf eine engagierte Person, die sich durch eine hohe Motivation, Team- und Kooperationsfähigkeit sowie eine selbstständige und verantwortungsbewusste Arbeitsweise und die Fähigkeit zur inter- und intradisziplinären Zusammenarbeit auszeichnet.
Berufsfeld
Öffentlicher Dienst, Verwaltung
Informationstechnologie, TK
IT/TK Softwareentwicklung
Forschung, Lehre
Forschung & Entwicklung
Biologische, Klinische F&E
Standorte
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